Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2aA2A9G7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shisal2aA2A9G7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms