Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YCQ6

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YCQ6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A286YCQ6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A286YCQ6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A286YCQ6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms