Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn3Q9WUK7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn3Q9WUK7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Opn3Q9WUK7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.8 ms