Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stub1Q9WUD1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stub1Q9WUD1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stub1Q9WUD1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stub1Q9WUD1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stub1Q9WUD1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stub1Q9WUD1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stub1Q9WUD1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stub1Q9WUD1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stub1Q9WUD1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Stub1Q9WUD1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stub1Q9WUD1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 275.6 ms