Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bcl11aQ9QYE3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bcl11aQ9QYE3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11aQ9QYE3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms