Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hacd1Q9QY80 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hacd1Q9QY80 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms