Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irx4Q9QY61 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx4Q9QY61 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx4Q9QY61 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms