Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY24

Zbp1, Z-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbp1Q9QY24 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbp1Q9QY24 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbp1Q9QY24 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbp1Q9QY24 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms