Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm4Q9QXA5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm4Q9QXA5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm4Q9QXA5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms