Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWT9

Kifc1, Kinesin-like protein KIFC1, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc1Q9QWT9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kifc1Q9QWT9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kifc1Q9QWT9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kifc1Q9QWT9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kifc1Q9QWT9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kifc1Q9QWT9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kifc1Q9QWT9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kifc1Q9QWT9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kifc1Q9QWT9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kifc1Q9QWT9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kifc1Q9QWT9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kifc1Q9QWT9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kifc1Q9QWT9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kifc1Q9QWT9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kifc1Q9QWT9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kifc1Q9QWT9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kifc1Q9QWT9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kifc1Q9QWT9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kifc1Q9QWT9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms