Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB8

Cntn6, Contactin-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn6Q9JMB8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn6Q9JMB8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn6Q9JMB8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntn6Q9JMB8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntn6Q9JMB8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntn6Q9JMB8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntn6Q9JMB8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntn6Q9JMB8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn6Q9JMB8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn6Q9JMB8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn6Q9JMB8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn6Q9JMB8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn6Q9JMB8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn6Q9JMB8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn6Q9JMB8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn6Q9JMB8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntn6Q9JMB8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntn6Q9JMB8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntn6Q9JMB8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms