Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gkap1Q9JMB0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gkap1Q9JMB0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gkap1Q9JMB0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms