Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnkpQ9JLV6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PnkpQ9JLV6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnkpQ9JLV6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms