Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpf2Q9JJ80 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpf2Q9JJ80 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpf2Q9JJ80 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rpf2Q9JJ80 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rpf2Q9JJ80 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rpf2Q9JJ80 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpf2Q9JJ80 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms