Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn19Q9ET38 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Cldn19Q9ET38 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn19Q9ET38 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn19Q9ET38 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn19Q9ET38 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn19Q9ET38 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn19Q9ET38 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn19Q9ET38 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn19Q9ET38 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn19Q9ET38 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn19Q9ET38 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn19Q9ET38 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn19Q9ET38 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn19Q9ET38 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn19Q9ET38 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn19Q9ET38 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn19Q9ET38 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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