Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ush1cQ9ES64 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ush1cQ9ES64 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ush1cQ9ES64 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms