Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG2

Strn3, Striatin-3, mousemouse

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Length 796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn3Q9ERG2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Strn3Q9ERG2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Strn3Q9ERG2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Strn3Q9ERG2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms