Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stx12Q9ER00 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx12Q9ER00 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms