Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SgshQ9EQ08 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SgshQ9EQ08 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SgshQ9EQ08 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms