Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Swt1Q9DBQ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Swt1Q9DBQ9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms