Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prpf4Q9DAW6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf4Q9DAW6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf4Q9DAW6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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