Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3bQ9DA80 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph3bQ9DA80 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsph3bQ9DA80 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms