Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P2

Ccdc103, Coiled-coil domain-containing protein 103, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc103Q9D9P2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc103Q9D9P2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc103Q9D9P2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc103Q9D9P2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc103Q9D9P2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc103Q9D9P2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc103Q9D9P2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc103Q9D9P2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc103Q9D9P2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc103Q9D9P2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc103Q9D9P2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc103Q9D9P2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc103Q9D9P2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc103Q9D9P2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc103Q9D9P2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc103Q9D9P2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc103Q9D9P2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc103Q9D9P2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms