Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8L0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8L0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8L0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8L0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D8L0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D8L0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8L0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8L0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.3 ms