Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AplfQ9D842 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms