Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmigd1Q9D7L8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmigd1Q9D7L8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms