Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D7E4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D7E4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D7E4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D7E4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D7E4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D7E4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D7E4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D7E4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D7E4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D7E4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D7E4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D7E4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D7E4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms