Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf225Q9D7D1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf225Q9D7D1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms