Protein–RNA interactions for Protein: Q9D711

Pir, Pirin, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PirQ9D711 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PirQ9D711 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PirQ9D711 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PirQ9D711 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PirQ9D711 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PirQ9D711 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PirQ9D711 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms