Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc52a3Q9D6X5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc52a3Q9D6X5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a3Q9D6X5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms