Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Katnal2Q9D3R6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Katnal2Q9D3R6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Katnal2Q9D3R6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms