Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hddc3Q9D114 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hddc3Q9D114 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms