Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prpsap1Q9D0M1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpsap1Q9D0M1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpsap1Q9D0M1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpsap1Q9D0M1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpsap1Q9D0M1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpsap1Q9D0M1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms