Protein–RNA interactions for Protein: Q9D099

Acer3, Alkaline ceramidase 3, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acer3Q9D099 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acer3Q9D099 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acer3Q9D099 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acer3Q9D099 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acer3Q9D099 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acer3Q9D099 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acer3Q9D099 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acer3Q9D099 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Acer3Q9D099 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms