Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nde1Q9CZA6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nde1Q9CZA6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms