Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChtopQ9CY57 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChtopQ9CY57 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms