Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem50aQ9CXL1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem50aQ9CXL1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms