Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prkrip1Q9CWV6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Prkrip1Q9CWV6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prkrip1Q9CWV6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prkrip1Q9CWV6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182 ms