Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufb5Q9CQH3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufb5Q9CQH3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufb5Q9CQH3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufb5Q9CQH3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb5Q9CQH3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb5Q9CQH3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb5Q9CQH3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb5Q9CQH3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb5Q9CQH3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb5Q9CQH3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufb5Q9CQH3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms