Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms