Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtpbp4Q99ME9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtpbp4Q99ME9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms