Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SardhQ99LB7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SardhQ99LB7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SardhQ99LB7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms