Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rsl24d1Q99L28 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rsl24d1Q99L28 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsl24d1Q99L28 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms