Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lactb2Q99KR3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lactb2Q99KR3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms