Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG5

Lsr, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsrQ99KG5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LsrQ99KG5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LsrQ99KG5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LsrQ99KG5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LsrQ99KG5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LsrQ99KG5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms