Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krcc1Q99JT5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms