Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Spdl1Q923A2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Spdl1Q923A2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms