Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NelfcdQ922L6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms