Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atpaf2Q91YY4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atpaf2Q91YY4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atpaf2Q91YY4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms