Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdha12Q91Y18 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha12Q91Y18 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms